在過去的幾十年里，由于人口迅速增長，而且大多數(shù)集中在長江兩岸，從而誘發(fā)了大規(guī)模的圍湖造田。長江流域的湖泊因此大面積萎縮，僅洞庭湖的面積就比全盛時期縮小了一半以上，江漢平原的湖泊從1000多個減少到目前的300個。
濕地面積的減少，加大了雨季洪水的危害。據(jù)史料記載，長江流域在唐代以前平均20年左右發(fā)生一次洪澇災害，以后逐漸增加，進入29世紀80年代以來平均每兩年一次，有時甚至連年發(fā)生。濕地的破壞還使水資源得不到涵養(yǎng)。中國人均資源占有量僅是世界人均占有量的25%，其中40%來自于長江。如不及時保護長江水資源，中國將很快面臨嚴重的淡水危機。
流域內(nèi)動植物的生存環(huán)境也被人類的各種開發(fā)活動嚴重破壞，100多種洄游性魚類和上百種越冬候鳥面臨威脅。
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